С принятием в 1993 г. ТК РФ валютное законодательство было дополнено положениями, касающимися наделения ГТК России статусом органа валютного контроля (ч. 1 ст. 198 ТК РФ), а иных таможенных органов - статусом агентов валютного контроля (п. 16 ст. 10, ч. 2 ст. 198 ТКРФ).

В соответствии со ст. 199 ТК РФ к компетенции таможенных органов относится осуществление валютного контроля за перемещением лицами через таможенную границу РФ, за исключением периметров свободных экономических зон и свободных складов, валюты РФ, ценных бумаг в валюте РФ, валютных ценностей, а также за валютными операциями, связанными с перемещением через указанную границу товаров и транспортных средств.

При этом, согласно ст. 200 ТК РФ, таможенные органы осуществляют валютный контроль в соответствии с валютным и таможенным законодательством РФ применительно к таможенному контролю. То есть, с одной стороны, при осуществлении таможенными органами валютного контроля ими используются формы, методы и правила проведения таможенного контроля, установленные таможенным законодательством РФ, а с другой - таможенные органы не вправе контролировать валютные операции, совершаемые вне связи с действиями, подпадающими под таможенный контроль.

Согласно ТК РФ, при выявлении таможенными органами в ходе осуществления валютного контроля нарушений валютного законодательства РФ, являющихся одновременно нарушениями таможенных правил, лица, совершившие такие нарушения, несут ответственность в соответствии с ТК РФ. В иных случаях ответственность за нарушения валютного законодательства, выявленные таможенными органами, наступает в соответствии с валютным и другим законодательством (ст. 201 ТК РФ).