В связи с внесением в 1999 г. в Закон о налоговых органах Российской Федерации изменений, которыми к числу органов валютного контроля было причислено и МНС России (п. 14 ст. 7 Закона о налоговых органах), соответственно, иные налоговые органы получили статус агентов валютного контроля в пределах своей компетенции (ст. 1, 6 Закона о налоговых органах).

К сожалению, действующее законодательство детально не расшифровывает содержание валютно-контрольных полномочий налоговых органов. В связи с этим представляется весьма затруднительной реализация ими вышеуказанных норм Закона о налоговых органах, особенно учитывая бланкетный характер их диспозиций.

Частные полномочия МНС России как органа валютного контроля сформулированы в различных подзаконных нормативных правовых актах и носят преимущественно специальный характер.

Так, МНС России (как правопреемнику Госналогслужбы России) предоставлено, наряду с Инспекцией валютного контроля, право налагать штрафы за нарушения порядка зачисления резидентами валютной выручки от экспорта на счета в уполномоченных банках.

В свою очередь, местные органы МНС России в соответствии с п-31 Инструкции Банка России № 7 принимают участие (совместно с Главными территориальными управлениями Банка России и Инспекцией валютного контроля) в проведении проверок уполномоченных банков по обеспечению правильности и своевременности осуществления расчетов, связанных с обязательной продажей части экспортной выручки, и применяют санкции в соответствии с действующим законодательством.

Помимо вышеуказанного, МНС России предоставлено право взыскания штрафов за нарушение порядка зачисления валютной выручки на счета резидентов в уполномоченных банках в размере всей сокрытой выручки (п. 28 Инструкции Банка России № 7, ч. 2 Разъяснения Госналогслужбы России от 27 августа 1993 г. № ЮУ-4-06/132н "О применении штрафных санкций за нарушение порядка зачисления валютной выручки на счета в уполномоченных банках Российской Федерации").

Следует, однако, признать, что наиболее реальный вклад налоговых органов в осуществление валютного контроля в настоящее время ограничивается выявлением случаев нарушения валютного законодательства с последующим привлечением к производству по указанным делам иных органов валютного контроля.